Neben den vielfältigen Werken in Sakralbauten, unter anderem in Form von Glasfenstern, Deckengemälden und skulpturaler Gestaltung (Autobahnkirche Baden-Baden) sowie Aufträge für Kunst am Bau, schuf Emil Wachter ein immenses Epos weltlicher Malerei.

Es umfasst Tuschen und Aquarelle mit geradezu fernöstlicher Anmut und Poesie, ebenso wie Ölbilder, die durch unaufdringliche Farbigkeit und Vielschichtigkeit Landschaften, Menschen und skurrile Tiergestalten zum Leben erwecken.